Vykdo vaiko teisių apsaugos funkciją, organizuoja neigiamos tėvų antivisuomeninio elgesio ir kitų institucijų įtakos vaikams prevenciją,;organizuoja atstovavimą vaikams ir jų teisių bei interesų gynimą, organizuoja vaikų (našlaičių), likusių be tėvų globą.
Centro paskirtis – pagal kompetenciją įgyvendinti valstybės politiką visuomenės sveikatos priežiūros ir vartotojų teisių apsaugos srityse, vertinti ir valdyti riziką žmonių sveikatai, susijusią su paslaugomis, gaminiais, aplinkos veiksniais ir užkrečiamosiomis ligomis.
Centras teikia ambulatorinę medicininę pagalbą ūmių psichikos sutrikimų atvejais, vykdo ambulatorinę psichikos sveikatos priežiūrą bei teikia pagalbą dvasinės krizės ištiktiems asmenims ir jų artimiesiems.
